临床医学专业设立于1958年，是学校传统优势专业。1977年学校招收第一批临床医学专业五年制本科生，1979年招收临床医学专业硕士研究生；1981年学校获得国务院学位委员会学士学位和硕士学位授予权；2010年获批为安徽省特色专业建设点；2010年始招收临床医学专业免费定向生（农村订单定向医学生）；2012年获批安徽省“临床医学专业卓越医师培养模式创新实验区”建设项目；2013年获批教育部、国家卫生和计划生育委员会第一批临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点单位；2017年，临床医学专业进入安徽省普通本科第一批次招生；2019年，获批为安徽省本科专业一流建设点，获安徽省临床医学专业综合评估“优秀”等次；2020年，获批国家级一流本科专业建设点、安徽省教育厅高峰学科（III类），并通过教育部临床医学专业认证，有效期为6年。

临床医学拥有一级学科硕士学位授权点（二级学位点10个）和专业学位授权类别，临床医学博士学位授权类别为安徽省博士学位授予单位立项建设拟申报学科，现硕士研究生每年招生430人左右。2019年以来临床医学学科稳定在ESI全球排名前1%，临床医学下属8个二级学科进入科技量值（STEM）全国百强，2021年麻醉学STEM排名全省医疗机构第1名，4个学科进入五年总科技量值（ASTEM）全国百强，其中烧伤外科、麻醉学均排名全省医疗机构第1名。设有国医大师工作室1个，建有国家级重点建设学科3个、省级临床重点专科和重点培育专科11个、校级重点学科6个；国家级住院医师规范化培训基地、国家级全科医生培养基地、安徽省住院医师规范化培训骨干师资培训基地、安徽省全科师资培训基地、省级示范实验实训中心。现有直属附属医院2所，非直属附属医院8所，教学医院14所；在北京、上海、深圳、江苏、浙江和安徽等省市拥有校外实践教学医院48所。

临床医学专业现有在校生3241人，其中免费医学定向生227人。现每年招生570人左右，生源来自安徽、江苏、浙江、河北、新疆等12个省份。学院坚持以立德树人为根本，以学生能力培养为核心；坚持立足安徽，面向全国，服务基层的人才培养定位，着力培养基础宽厚、临床综合能力强、德智体美劳全面发展的应用型高素质医学人才。办学六十余年，临床医学专业为国家输送三万余名医学人才，涌现出一批杰出校友。如首届“国之名医”获得者原南京军区南京总医院普外科主任李宁;曾任中华医学会麻醉学会常委姚尚龙；第十四届全国政协常委、教科卫体委员会委员黄宇光等。近三年学生获批国家级、省级大学生创新创业训练计划项目100余项、以第一作者发表学术论文50余篇，获全国大学生“千校千项”评比全国一等奖、全国首届脑科学与脑技术创新大赛二等奖、安徽省“互联网+”大学生创新创业大赛金、银、铜奖，“挑战杯”大学生课外学术科技作品竞赛国家级三等奖和省级一、二、三等奖等累计40余项；陈梦露、李璐等10余名优秀学子获得“中国大学生自强之星”“安徽省优秀团员”“安徽省优秀青年志愿者”“安徽省大学生自强之星”等荣誉称号。

学制、学位与学费：学制五年，授予医学学士学位；5720元/生·学年。

就业情况：近三年毕业生毕业去向落实率约96%，硕士研究生录取率约42%；许多优秀毕业生被清华大学、北京大学、北京协和医学院、上海交通大学、复旦大学等“双一流”高校录取为硕士研究生；就业单位为医疗卫生事业单位和高等医药院校等。